交辦事項

【整理DATA】
V1.找出同一次同一人入出院的資料將其合併(以帳號)，再刪除非stroke的診斷。

2.閱讀文章

3.codebook老師的註解整理與釐清
(1)確認各個項目是否有manual，後續可修改或建立之
(2)BI總分是由電腦自動加總，還是由治療師key-in呢？
電腦加總，但治療師可修改
若是由治療師輸入的，是否可能有誤差？
若是由治療師輸入，則建議日後可改為電腦加總。
(3)MMSE missing data比例？


好像能體會老師說能夠專心投入做研究是一件美好的事情，
若無閒事掛心頭，便是研究好時節...

◎掃描圖片(下班後借玉雲姊電腦)
◎大三實習線上學習方法給老師

◎8/11晚6-8點 協助 fMRI scan
◎8/19晚6-8點 協助 fMRI scan

◎聯合IRB期中報告
先回信給莊老師 DONE
撰寫期中報告 DONE
找莊老師簽名、送IRB(8/13 星期三早上)

◎大三實習課程：
預約CPR實習教室：填單→送主任蓋章→臨床技能中心 DONE
預約CPR講師與助教：DONE
預約葉護理師上課：DONE
詢問台大教學部規定是否去年相同：DONE

各醫院見習學生名單DONE、公文繕打DONE、寄件(差三家醫院資料未到)
製作CPR證書/試卷/評分表
送公文至杏誠診所！(老師check後可寄出)

◎8/1前完成北醫PROTS期中報告(需1000元審查費)
目前完成約95% (差薛老師及侯醫師簽名)薛8/88/5中午
要與侯醫師約時間請侯醫師簽名 侯8/5下午兩點門診診間
再完成IRB繳費、送件(星期五上午)  DONE!

◎幫薛老師瞭解OTseeker怎麼查資料

◎北醫的Hsueh帳號是誰申請的→Pain

部分response categories紀錄

資料方面還沒最後確定，先用入院資料的人次來確認response categories，
還真是...有點多元XD

(一)年齡：數字  (N=2331, missing=2)
　　min-max=5-109   →有很小部分是小兒個案，須排除
　　mean(SD)=64.74 (16.19)
　　median=66

(二)性別：M=男性；F=女性 (N=2331, missing=2)
　　男：女=1328：1003

(三)教育程度(N=2333)：目前看到的共有50種記錄方式，大致可分為
　　1.Missing、無法評估、無、NT (N=46)
　　2.可能是小兒個案的 (N=6)
　　3.不識字 (N=165)
　　4.識字、小學、國中 (N=946)
　　5.高中職 (N=513)
　　6.專科、大學、研究所 (N=657)

(四)姿勢控制能力(N=2333)：目前看到的共有34種記錄方式，但大致可分為

姿勢控制能力	靜態坐姿	動態坐姿	靜態站姿	動態站姿
Good	1195	744	464	168
Good-	321	366	300	371
Fair+	80	109	130	82
Fair	89	134	148	120
Fair-	82	50	92	32
Poor+	124	44	121	38
Poor	308	382	546	653
unable	0	3	13	14
NA	114	445	481	770
NT	16	52	33	79
Missing	4	4	5	6

(五)ADL Status
【BI】：數字  (N=2330, missing=3)
　　min-max=0-100  
　　mean(SD)=21.42 (29.86)
→平均數無意義，大部分0分並非真的0分，而是missing，須另外挑出來
　　median=0

【ADL status】：獨立程度
理論上，應為六種評分：
Independence, Supervision, Minimal assistance,
Medial assistance, Maximal assistance, Dependence
但因為沒有註記欄，因此很多的寫法都是獨立程度加上註記
所以有部分項目有100種以上，甚至bed_mobility有將近500種...
需要進一步做取代跟確認

(六)Motor recovery(N=2331)：羅馬數字Ｉ～ＶＩ，共約有將近40種計分方式，
　　將寫成at leastXX的與XX合併，大致可分為

	UE_PROXIMAL	UE_DISTAL
Missing	188	197
Ⅰ	203	351
Ⅰ~II	1	0
Ⅱ	318	265
Ⅱ~Ⅲ	124	54
Ⅲ	93	72
Ⅲ~Ⅳ	114	103
Ⅳ	98	105
Ⅳ~Ⅴ	139	77
Ⅳ以上	1	3
above Ⅴ	0	1
Ⅴ	308	221
Ⅴ~Ⅵ	266	331
Ⅵ	470	547
NA	9	6
NT	1	0

1.需要進一步把不是stroke的個案去掉
2.有些只寫at least，把stage幾寫在註記裡，但還好只有兩個，
　所以可能之後整理DATA時還要再確認有沒有是填到註記欄裡面的
3.寫XX以上或aboveXX的，有點難以歸類，但屬少數
4.有I~II這種分類嗎...= ="
5.建議填寫stage的欄位就只填stage「XX」，
　其他像是at least、by observation等等的都填在註記欄，
　有利於資料整理與分析

(七)配合度+動機

配合度	次數		動機	次數
Missing	10		Missing	11
Good	1432		Good	1170
Good-	3		Good-	7
Fair+	8		Fair+	9
Fair	614		Fair	775
Fair-	4		Fair-	3
poor+	4		poor+	5
poor	235		poor	289
			Depress mood	1
NA	20		NA	60
hard to check	2		hard to check	2
could not test	1		could not test	1

To be continued...

7/24「台大醫療體系醫療整合資料庫標竿學習」課程紀錄

系列演講主題：建置「臺大醫療體系醫療整合資料庫」：醫院健康資料庫運作經驗標竿學習

本場主題：醫療資料整合經驗─成大經驗
講者：呂宗學 教授
成功大學醫學院公共衛生研究所教授
成功大學健康資料加值應用研究中心主任
http://healthdata.rsh.ncku.edu.tw/files/11-1294-10917.php

1.Better Information Better Actions
必須有更多的資料可以應用才能夠使各方（醫療提供者、商業提供者...）能夠採取更多對人類健康或其他目的有助益的行動。
以醫療與公衛的資料運用來說，可經由資料處理分析進一步作出預測病人預後的系統，可給予醫療提供者判斷病人預後的依據(講者舉的例子是現在病人常常會問醫師自己會好嗎？會好到什麼程度？ 醫師只能依據經驗大概猜猜，但沒有實證的依據)，也是協助醫師下診斷及處方的決策系統。
惟目前國內大型資料庫僅包含健保、出生、癌登和死因統計，
但內容包含的項目深度及廣度不足，且較缺乏基礎醫學及方法學方面的基礎，
最開始設計的目的也不完全為了日後可以進行醫療照護深入的研究，
故雖能夠作某些方面的研究，但仍有許多不足。
各醫療院所雖有較完整的診斷、檢驗等資料，但即使以同一家醫院而言資料都可能存在於不同系統、使用不同軟體、不同格式，且各家醫院尚有利益考量，要整合並共享各家醫院的資料更是不容易，另外病歷資料還涉及人權及隱私爭議，目前仍是分散且難以使用，嚴重影響台灣醫學研究。
故應致力於成立全國性的資料庫(雲端資料庫)，除了一般病歷資料外，應加入病人自陳評量、生物資料庫、文字型半結構資料等，使資料domain更完整；而後續的分析技術(包含軟硬體)也應該要有所發展及進步，相輔相成。

2.成大醫院經驗
由77年成立至今，修改過幾次病歷相關的內容及系統，因此首先花了許多時間在作整合及資料核對，且資料是分科儲存(外、內等臨床科別，此外還有行政、財務類的科別)，目前僅完成部分科別的資料整合。
心得：這部分我覺得主要是要有熱心的leading team，成員像講者所說的應該要包含臨床醫療人員和資工人才透過一段時間的努力去把資料庫建起來，不知道台大有沒有人在進行這方面的努力？(演講中台大的醫師是沒有提到台大的部分)畢竟是一個很大的工程，需要長時間的努力，最重要的是要有心...

3.關於人權與隱私方面的問題
國內似乎有些人權團體是反對病歷資料分享的。講者提到依國外的經驗，其實要逐個病人簽同意書其實也不是不可能，例如可以在健保卡註記病人願意或不願意分享他的病歷資料(當然，在資料庫有安全的保護及去連結之類防護的情況下)，則或許日後真的能夠建立整合的資料庫時，就能夠在醫療上進行更多有助於增進全人類健康的研究。但最大的問題還是在不同醫院不同財團的利益= =

4.使用健保資料庫有其Bias
講者提到使用健保資料庫的資料時，必須要去瞭解建檔方式，因為健保資料庫的資料經過醫師、醫院、健保局等重重關卡，可能有許多運算跟操作在裡面，因此解讀資料時，須特別注意資料的處理過程。

5.National Information Exchange Model(NIEM)
目前已進入Big Data Era。NIEM的概念上是建立一個雲端的資料交換平台。美國目前已有為罪犯、醫療保險等建立的資料交換平台，各地要提取相關的資料都相當方便，有較為完整的通報系統、或決策系統，並使用CDX軟體，用data mapping的概念，快速有效率的提取在資料庫中所需要的資料。
NIEM：http://ppt.cc/v~ls
CDX-crossflo systems：http://ppt.cc/9tZy


今天演講內容以資料庫的建置為主，其實跟從謝老師那裡得到的概念差不多。
只是有了概念之後，要如何實際執行，似乎又是另外一個世界...

20140722-23 討論紀錄

因為颱風來有點風雨，跟孟真改約其他時間，
這兩天先在線上進行簡單討論，以下簡單記錄：

◎孟真(動機vs功能預後)

◎醫院評鑑中對於病歷之規定

　網路上找到的資料似乎是只規定大方向，應該對於病歷內容不會有太大影響。

◎OT電子病歷系統建置流程

　OT病歷內容及填寫準則由OT內部參照醫院對醫師的規定(醫療法/醫師法)、OT法、各種評鑑的建議內容，由負責OT擬稿再與其他同仁討論後訂定。再與資訊室人員討論建置資料庫。(若高層不反對即有修改之可能)

　醫師用的是醫院portal 系統與OPT不同，OPT用的是表單系統 (類似外掛上去的系統)

所以PT系統跟OT一樣 可以獲得excel 檔的資料可能性較大 (前提是之前表單建置時有建置要提取資料到XML資料庫)。若需要醫師的資料則有些麻煩？！

電子表單主要可存成3種檔案形式
　　1. XML，可以以excel輸出
　　2. HTML 也就是平常調閱電子表單的樣子
　　3. 原始檔(不確定功能)

◎Excel檔各欄位之代表意思及response category.

　※ 檔案名稱是385開頭的是initial note；386的是DC note？
　※ 整個表格(code book)內容確認。→跑次數分配表確認
　※ 可能還需要的資料：評估日期？(同資料建立日期？ＮＯ！)、pt的出生年月日

孟真：OT 評估的BI與MMSE 資料不完整 很多病人會沒有評 可能需參考用醫師評估的

醫師住院病人必評BI 與MMSE 所以完整性應較好，但需一筆一筆查詢與輸入！

擬請教孟真的問題

目前想到想請問孟真的問題：

◎孟真目前進展(與病歷相關的部分)

◎OT電子病歷系統建置流程(是由OT本身討論？由醫師決定？)

◎醫院評鑑中對於病歷之規定

◎電子病歷資料索取流程(若我們還有缺資料是由孟真幫忙向資訊室索取？)--Yes! : )

◎Excel檔各欄位之代表意思及response category--已整理，但仍有部分欄位要跟孟真確認

7/18 與老師討論之紀錄

1.由與特定的機構合作開始，逐步修改(也許3-5年修改一次)，需要長時間的投入與努力

2.醫院評鑑內容雖會影響病歷紀錄的內容，但並非絕對，病歷紀錄內容與臨床人員的時間壓力或改良意願亦有很大相關

3.有關醫院評鑑及病歷內容等細項問題可與孟真約時間定期討論

4.也許目前的評估工具標準化程度不足或有其他像是施測者間的隨機誤差，但因為樣本數大於團體資料分析時可不用過度擔心此問題。但若是如臨床般注重個別病人的情況下，則不可忽略隨機誤差

5.下週一中午跟老師確認下次討論時間

6.目標：發展整合式電子病歷紀錄系統

任務：

1.確認變項資料完整性(改有的要有，缺的看是否有可能補上→資訊室)

2.重要變項名稱、response category、missing data (可請教孟真)

3.建立code book：先以postural control、ADL 和 Brunnstrom stage的資料為主



老師的資料整理流程

電子病歷資料庫
(要練習怎樣畫出好看又好懂的圖...很沒有美感Q Q 好像螃蟹...)
(不確定這樣的概念是否正確？)

7/18 任務

◎本日目標：閱讀病歷資料分析與改良文章

1.對於分析的部分比較能夠理解，不過要改良真的是需要細水長流的大工程!

另外，由於舊有病歷已行之有年，加上評鑑及時間壓力，會擔心是否能夠推廣，

不過感謝老師總是給與許多正面的想法，急不來! 

2.NTUH-PhysOT chart

   似乎主要能夠用以分析的仍是 initial & discharge note，progress note 和 daily 的格式較不同，且比較偏向質性的SOAP寫法。

3.Excel資料(是initial note與discharge note的內容？)為OT的資料，之後會有需要review Dr. 的chart??

◎下週四7/24(四)下午聽演講

【演講公告】2014/7/24(四) 建置「臺大醫療體系醫療整合資料庫」：

標竿學習其他醫院健康資料庫運作經驗

日期	講者	地點
2014/7/24(四) 16:00-17:30	呂宗學  教授 成功大學醫學院公共衛生研究所教授 成功大學健康資料加值應用研究中心主任	臺大醫院 兒醫大樓B1講堂

一、主辦單位：臺大醫院醫學研究部

二、活動說明：健康資料庫在國內、外醫學研究與應用上所扮演的角色日趨重要，目前本院亦積極建置「臺大醫療體系醫療整合資料庫」。為學習其他醫院資料庫建置與運作之寶貴經驗，特別邀請專家蒞院演講。

◎參考老師部落格文章

臨床病歷記錄（評估工具）效能亟待提升

三大領域皆然（目前之效能低落：評估/記錄費時，但評估數據之用途有限）
研究人員應協助之
可往「電腦化」結合「電子病歷」為主要方向
評估工具之修改與驗證應為主要方法學

今天（4/30）到輔大演講，他們的附設醫院將於2017年開張，如果他們OT學系能夠掌握臨床病歷之設計與改良，則研究題材與成果，盛況可期！

May 5, 2014: 上週五完上遇到馬偕歐育志，想到馬偕OT之電子病歷已執行多年，擬瞭解輸出與分析機會。
週六與亞東陳明輝主任提及電子病歷分析，已安排 June 7 至亞東演講「病歷分析研究」，亞東也已執行病歷電子化，也進行瞭解如何輸出。
將考慮申請馬偕以及亞東之研究計畫！

如何協助臨床 病歷電子化 並 強化其功能

蠻多OT單位仍為執行病歷電子化，有些雖已電子化，但功能不佳（如輸入不便或未與其它單位整合）

故我想到「強化電子病歷效能計畫」，以期提升OT臨床效能。

•目的：提升OT電子病歷與臨床效能

•方法

•增加病歷輸入平台與效能（含 PC, notebook, Pad 有線/無線輸入模式，治療師輸入與個案填寫問卷）

•整合相關科室之病歷內容，以避免重複

•在有限增加治療師負擔的前提下，漸進改良病歷內容

•整合臨床決策輔助系統（含實證治療指引）

•結合有興趣之研究人員，齊力發展/驗證與修改

•經費來源（for 軟硬體/研究人員）：

•專案計畫（向院方申請）

•研究計畫（向院方申請）

•科室經費（由科內經費支付）

Note: Patient-reported outcomes 可由病人/家屬填寫之。於等待治療或治療後填寫。

Back again!

感謝老師的不嫌棄，又回到這個可愛的研究大家庭，

看到老師部落格po的文章，又有許多新血會加入，真是可喜可賀！

雖然這次是短期回來，希望可以發揮一點小小的力量，

盡可能地做點甚麼事情 ( 收案實在是我的罩門，真的很對不起老師 > < )



就...繼續麻煩大家多多指教了 <(_ _)>